Wappen:

In blau ein schräggestellter silberner (weißer) Karpfen

Flagge:

Weiß/blau (silber/blau)

Bis 1925 führte Gunningen noch ein Kreuz im Schultheißsiegel.

Offenstichtlich sollte damit auf die einstige Ortsherrschaft des Klosters St. Georgen hingewiesen werden. Der heilige Georg führte im Schild ein Kreuz, allerdings nur ein einfaches Balkenkreuz. Dieses Kreuz finden wir wieder im Wappen des Klosters, speziell diesmal im Wappen des Abtes Michael Glückler (1690-1733). Dieses ist heute an der Gunninger St. Georgskirche angebracht.

Im Jahr 1924 schulg die Archivdirektion Stuttgart vor, an die Erinnerung der vermuteten Zugehörigkeit einer Hälte des Ortes zur Herrschaft Karpfen im Mittelalter im blauen Feld einen schräggestellten silbernen Karpfen in Anspielung an das Wappen dieser Herrschaft als Gemeindewappen zu führen.

Bereits 1925 war dieses Siegel für das Bürgermeisteramt in Gebrauch.

Das Recht der Führung der Flagge weiß/blau wurde am 21. Februar 1968 vom Innenministerium verliehen.